Esikoha võitnud FC Elva kindlustas sellega endale ka pääsu järgmiseks hooajaks teise liigasse. Teisena lõpetanud Jõgeva SK Noorus-96 kaotas II liiga üleminekumängudes Keila JK-le 3:4 ja 1:6 ja peab ka järgmisel aastal III liigas mängima.
Kolmanda koha pälvis Võru JK. Kümnendana lõpetanud Valga FC Warrior II kaotas üleminekumängudes IV liiga meeskonnale SK Tääksile 0:0, 0:1 ja langeb IV liigasse, nagu ka Navi Vutiselt ja Tartu Ülikool Fauna.
Liiga parimaks väravalööjaks tõusis Mairo Tikerberi Jõgevalt 28 löödud väravaga.
Kuna tavaliselt toimub hooaegade vahetuse jooksul arvukate uute meeskondade teke ja ka mõnede loobumine, siis selguvad 2012. aastal III liigas osalejad lõplikult alles 2012. aasta märtsiks.